Za odvajanje toplote so običajno potrebni veliki kovinski radiatorji ali ventilatorji. Druga pomanjkljivost je, da so velike in težke. Dobra stran je, da komponente v linearnem napajalniku (razen transformatorjev) obvladujejo le nizke napetosti, izhod pa je zelo stabilen in brez hrupa. Preklopni napajalniki delujejo zelo različno: namesto da odvečno električno energijo pretvorijo v toploto, hitro vklopijo in izklopijo napajanje. Pri preklopnem napajalniku se AC vhod pretvori v visokonapetostni enosmerni tok, nato pa se napajalnik vklopi in izklopi tisočkrat na sekundo, s skrbnim nadzorom preklopnih časov, tako da izhodna napetost v povprečju znaša do želeno vrednost. Teoretično se ne troši elektrika, čeprav bi bil v praksi izkoristek 80-90%. Preklopni napajalniki so učinkovitejši, ustvarjajo manj toplote ter so manjši in lažji od linearnih napajalnikov. Glavna pomanjkljivost preklopnega napajanja je, da je veliko bolj zapleten od linearnega napajanja in ga je veliko težje načrtovati. Poleg tega so zahteve po komponentah višje, kar zahteva, da lahko tranzistorji preklapljajo pri visokih hitrostih pri visoki moči. Stikala, induktorji in kondenzatorji v stikalnih napajalnikih so lahko razporejeni v številnih različnih konfiguracijah (ali topologijah) z imeni, kot so buck, boost, flyback, forward, push-pull, half-wave in full-wave.
